Tên gốc của làng là Kim Hoa. Vì kỵ húy mẹ Vua Thiệu Trị là Hồ Thị Hoa, nên năm Tân Sửu (1841) đổi tên là làng Kim Liên, đây là một trong 36 phường của Kinh đô thời Lê, có Đình - Đền Kim Liên là Trấn Nam kinh thành Thăng Long. Kim Liên xưa bao gồm cả đất Trung Tự, Kim Hoa, Phương Liên.